O PPGSAAM conta com toda a infraestrutura do Instituto de Medicina Veterinária e desenvolve atividades junto ao Hospital Veterinário (Setor de Grandes Animais, Setor de Pequenos Animais e Setor de Animais Silvestres), Laboratório de Patologia Clínica, Laboratório de Zoonoses e Saúde Pública, Laboratório de Microbiologia e Imunologia, Laboratório de Patologia Animal, Laboratório de Parasitologia Animal, Laboratório de Higiene e Qualidade dos Alimentos, Laboratório de Nutrição Animal, Laboratório Multiusuário de Imunodiagnóstico e Biologia Molecular Aplicado à Saúde Animal na Amazônia, Laboratório de Epidemiologia e Geoprocessamento e Central de Biotecnologia de Reprodução Animal (CEBRAN).

O Hospital Veterinário é um hospital escola e apoia às atividades de ensino e pesquisa de todas as Subunidades do Instituto de Medicina Veterinária. O HV é dividido no Setor de Clínica Médica e Cirúrgica de Animais de Produção, Setor de Clínica Médica e Cirúrgica de Cães e Gatos e Setor de Clínica Médica e Cirúrgica de Animais Silvestres da Fauna Nativa. Possui ainda uma seção de análises clínicas, uma seção de diagnóstico por imagem e setores de sustentação.

O Setor de Clínica Médica e Cirúrgica de Animais de Produção possui os blocos de Clínica Médica e Clínica Cirúrgica. O Bloco de Clínica Médica tem 816m2 e é constituído por uma sala de recepção, uma sala de exame clínico, dez baias para grandes ruminantes, oito baias para equídeos, quatro baias para pequenos ruminantes, um tronco para bovinos e bubalinos, um tronco para equinos, plataforma de embarque e desembarque, uma sala para preparação de medicamentos e esterilização de materiais, dois vestiários, dois banheiros, uma sala de professores e o Laboratório de Patologia Clínica. O Bloco de Clínica Cirúrgica com 410m2 é constituído por uma sala pré-cirúrgica para animais, uma baia de recuperação anestésica, uma sala de raio-X, uma sala de revelação, uma sala de esterilização, uma sala de antissepsia pré-cirúrgica, uma sala cirúrgica com uma mesa cirúrgica e um tronco para cirurgias em estação, uma sala da direção, uma sala de professores, um mini-auditório com capacidade para 30 pessoas, um almoxarifado, uma copa e dois banheiros.

O Setor de Clínica Médica e Cirúrgica de Cães e Gatos possui uma área total de 797,73 m2, sendo constituído pelos blocos de Clínica Médica e Clínica Cirúrgica. O bloco de Clínica Médica é constituído por uma sala de recepção, três consultórios, uma sala de emergência, uma sala de internação, uma sala de preparo e enfermaria, uma sala dos técnicos, uma almoxarifado, um dispensário, uma sala de lavagem de material, uma sala de esterilização, uma sala para embalagem de material, uma lavanderia, uma copa e um solário para cães e gato. O bloco de Clínica Cirúrgica é constituído por uma sala pré-cirúrgica para animais, uma sala de preparo da equipe técnica, uma sala de recuperação anestésica, duas salas de cirurgia e uma sala de antissepsia pré-cirúrgica. Este setor tem ainda dois vestiários (masculino e feminino), dois banheiros (masculino e feminino), uma sala de raio–X, uma sala de revelação, uma sala de ultrassonografia e endoscopia.

Setor de Clínica Médica e Cirúrgica de Animais Silvestres da Fauna Nativa possui uma área de solário externa, uma sala de quarentena, uma sala de internação de aves, uma sala de internação de mamíferos, um ambulatório para atendimentos, cozinha para o preparo de dietas para os animais e uma área de apoio à equipe de trabalho. Este setor conta também com a infra-estrutura do bloco cirúrgico do setor de Pequenos Animais, assim como com os dois vestiários (masculino e feminino), dois banheiros (masculino e feminino), a sala de raio–X, a sala de revelação, a sala de ultrassonografia e endoscopia.

O Laboratório de Patologia Clínica funciona em uma sala de 40m2 localizada dentro do HV-Setor de Grandes Animais. Este laboratório possui bancadas, ambiente climatizado e é equipado com 02 microscópios ópticos binoculares, 01 estufa para esterilização, 01 centrífuga, 01 microcentrífuga para capilar, 01 refrigerador, 02 espectrofotômetros, 01 contador eletrônico de células, 01 homogeneizador de sangue para 32 tubos, 01 contador diferencial de células, 01 analisador automático veterinário para hematologia, 01 analisador bioquímico automático, 01 analisador bioquímico semi-automático, 02 computadores e 01 impressora.

O Laboratório de Microbiologia e Imunologia funciona em uma sala de 35 m2 com bancadas e ambiente climatizado e possui 10 microscópios ópticos binoculares, 01 estufa bacteriológica, 01 centrífuga, 01 refrigerador, 01 espectrofotômetro de placas e cubetas, 01 balança analítica de precisão, 02 aparelhos de ar-condicionado, 01 fluxo laminar, 01 banho-maria, 01 capela de exaustão, 01 microscópio óptico com imunofluorescência, 01 aparelho de micro-ondas, 01 computador e uma impressora.

O Laboratório de Patologia Animal funciona em um prédio de 190m2, com bancadas e ambiente climatizado. Nesse prédio estão localizados gabinetes de professores, sala de microscopia, sala de corte de tecidos, sala de necropsia e uma câmara fria. Os seguintes equipamentos já foram adquiridos e estão sendo utilizados: 03 microscópios ópticos binoculares, 01 microscópio óptico binocular com cinco cabeças com câmera fotográfica, 01 estufa para esterilização, 01 balança analítica, 03 refrigeradores, 01 histotécnico, 01 corador automático, 02 micrótomos, 01 inclusor de parafina, 03 computadores, 02 impressoras, 01 banho-maria, 01 capela com exaustor, 01 criostato, 01 microscópio óptico binocular com câmera fotográfica e analisador de imagens e 01 destilador.

O Laboratório de Parasitologia Animal funciona em um prédio com 80 m2 com bancadas e ambiente climatizado, uma sala de processamento e análises parasitológicas, uma sala de diagnóstico molecular, um almoxarifado, dois gabinetes de professores, uma cozinha e dois banheiros (um feminino e outro masculino). Esse laboratório conta com os seguintes equipamentos: 01 microscópio óptico binocular com câmera fotográfica e analisador de imagens, 01 microscópio óptico para três observadores, 10 microscópios ópticos binoculares, 09 microscópios estereoscópicos, 01 homogeneizador com placa aquecedora, 01 contador de células automático, 01 estufa para esterilização, 02 centrífugas, 02 refrigeradores, 03 freezers, 01 autoclave horizontal digital, 01 balança analítica, 01 pHmetro digital, 01 incubadora B.O.D., 01 destilador em aço inox, 01 aparelho de GPS, 01 termociclador com gradiente de temperatura, 01 fonte para eletroforese, 01 microcentrífuga para capilar, 01 forno micro-ondas, 01 transiluminador U.V, 01 fluxo laminar, 05 computadores e duas impressoras.

O Laboratório de Higiene e Qualidade dos Alimentos possui uma área física de 110m2, com bancadas e ambiente climatizado. Conta com gabinetes de professores, sala de processamento de alimentos, sala de análise físico-química, sala de microbiologia, sala de esterilização e sala de recepção de amostras para análise. Esse laboratório conta ainda com os seguintes equipamentos: 03 microscópios ópticos binoculares, 01 lavador automático de pipetas, 02 estufas bacteriológicas, 01 centrífuga, 01 refrigerador, 01 freezer, 02 autoclaves verticais, 01 deionizador de água, 01 pHmetro digital, 01 contador de colônias digital, 01 destilador em aço inox, 01 balança analítica, 01 balança de precisão, 01 fluxo laminar, 01 estufa para secagem e esterilização, 01 dessecador, 01 homogeneizador de amostras, 01 forno micro-ondas, um banho-maria e 01 computador.

O Laboratório Multiusuário de Imunodiagnóstico e Biologia Molecular Aplicado à Saúde Animal na Amazônia tem uma área física de 71,5m2 e possui uma sala para extração de DNA e análise de amostras, uma sala para PCR em tempo real e uma sala para hemocultivo. Esse laboratório conta com os seguintes equipamentos: 02 termocicladores com gradiente, 01 termociclador para PCR em tempo real, 02 computadores, 01 fluxo laminar, 01 transiluminador U.V., 02 homogeneizadores do tipo Vortex, 01 purificador de água osmose reversa, 03 fontes para eletroforese, 02 centrífugas refrigeradas, 01 microcentrífuga, 01 banho-maria, 01 refrigerador, 01 freezer, três ultrafreezers, 01 balança analítica, 01 destilador em aço inox, 01 estufa de esterilização, 01 estufa bacteriológica, um espectrofotômetro de placa, um lavador de placa e uma máquina de gelo em escama.

O Laboratório de Epidemiologia e Geoprocessamento possui uma área física de 15m2 e está localizada adjacente ao Laboratório de Informática e conta com 02 computadores, 01 impressora multifuncional e aparelhos de GPS.

O Laboratório de Zoonoses e Saúde Pública tem uma área física de 74m2 e conta com 02 freezers, 01 refrigerador, 01 banho maria, 01 agitador de tubos, 02 centrífugas, 01 estufa de secagem, 04 estufas microbiológicas, 01 capela de fluxo laminar, 01 capela de exaustão, 02 microscópico ópticos, 01 micrsocópio de campo escuro, 01 microscópio de imunofluorescência, 01 phmetro, 01 balança analítica, uma autoclave de 30 litros vertical, 01 computador e 01 impressora.

Em todos estes laboratórios são ministradas aulas práticas e realizados experimentos e análise de dados dos discentes de graduação e pós-graduação. Adicionalmente, estes laboratórios realizam auxílio diagnóstico para os três setores do Hospital Veterinário e para outras instituições públicas e privadas.

A Central de Biotecnologia de Reprodução Animal (CEBRAN) também dá suporte às atividades técnico-científicas tanto na graduação como na pós-graduação. Esta Central possui uma área coberta de 1580m2 e possui um setor administrativo que conta com uma sala de direção, recepção, secretaria, banheiros, sala de aula e outras instalações como o Laboratório de Processamento e Congelamento de Sêmen Bovino e Bubalino, Laboratório de Manipulação de Embrião, uma sala de esterilização, salas de preparação e coleta de embriões, um curral, baias, brete fixo tipo Texas, um quarentenário, piquetes e capineiras. Os seguintes equipamentos já foram adquiridos e estão sendo utilizados na CEBRAN: 01 microscópio óptico binocular com câmera fotográfica, 03 microscópios ópticos binoculares, 01 microscópio estereoscópio, 01 vertoscópio, 02 estufas de secagem e esterilização, 01 estufa de CO2, 01 ultrassom de lavagem, 01 ultrassom de diagnóstico, 01 envasadora de sêmen, 01 impressora de mini-palheta, 01 centrífuga, 01 congelador de embriões, 35 containers de nitrogênio líquido, 02 refrigeradores, 04 freezers, 01 destilador em aço inox, 01 balança analítica, 01 fluxo laminar, 20 vaginas artificiais para bovinos, 06 eletroejaculadores para bovinos, 05 inoculadores para transferência de embriões em bovinos e 03 maletas para inseminação artificial em bovinos.